Ågestasjön är en näringsrik slättsjö som är i en igenväxningsfas. Sjön omges av betesmarker, sankängar, lövbackar och ett ädellövskogsbestånd väster om sjön. Ågestasjön och markerna mot sjön Orlången ingår i ett större område som numera är skyddat i Orlångslandskapets natureservat. Ågestasjön med omgivningar tillhör länets främsta häck- och rastfågellokaler. Sjön, dess stränder och våtmarkerna är skyddade genom tillträdesförbud för allmänheten tiden 15 april - 15 juli.
Fuktbetesmarkerna i närheten har även de höga värden som gulärla och ängspiplärka. Här finns även en del värdefulla växter. I ädellövskogen finns höga värden i form av sällsynta, s k rödlistade arter av svampar, lavar, mossor och insekter.
Foto: Tyresåns vattenvårdsförbund, Michael Wzdulski